Peningkatan tidak hanya dilakukan pada bagian rangka. Yamaha juga membekali FZR250R dengan suspensi depan yang telah ditingkatkan serta sistem pengereman depan menggunakan cakram ganda.
Kombinasi tersebut membuat FZR250R tidak hanya mengandalkan performa mesin berkapasitas kecil, tetapi juga memiliki perangkat kaki-kaki yang mendukung karakter sebagai motor sport.
Dengan bobot kering sekitar 141 kilogram, wheelbase 1.375 mm, dan tinggi jok 735 mm, dimensi FZR250R tergolong kompak.
Kapasitas tangkinya mencapai sekitar 16 liter untuk spesifikasi model 1989.
Secara visual, FZR250R 3LN membawa bahasa desain yang kuat dari keluarga FZR berkapasitas lebih besar.
Model 1989 hadir dengan fairing penuh dan tampilan agresif yang mengikuti karakter FZR400 serta FZR750.
Proporsi tersebut membuat FZR250R terlihat seperti versi lebih kecil dari motor sport Yamaha dengan kapasitas mesin lebih besar.
Pada pembaruan 1990, Yamaha kembali melakukan perubahan pada bagian depan.
Motor tersebut mendapatkan konfigurasi projector twin headlamp, sedangkan desain bodinya diselaraskan dengan FZR400RR.
Gaya desain tersebut kini justru menjadi salah satu daya tarik FZR250R bagi penggemar dan kolektor motor klasik Jepang.
FZR250R tidak hanya hadir dalam satu spesifikasi. Kode 3LN berkembang melalui beberapa versi selama masa produksinya.
Model 3LN1 diperkenalkan pada 1989. Setahun kemudian muncul 3LN3, disusul 3LN5 pada 1991.